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酶譜法的基本過程是先將樣品進行SDS-聚丙烯酰胺（SDS-PAGE，含0.1%明膠）電泳分離，然后在有二價金屬離子存在的緩沖系統中使樣品中的MMP-2和MMP-9恢復活性，在各自的遷移位置水解凝膠里的明膠，zui后用考馬斯亮藍將凝膠染色，再脫色，在藍色背景下可出現白色條帶，條帶的強弱與MMP-2和MMP-9活性成正比。

復性原理：在電泳過程中，SDS與樣品中的MMPs結合（當然是可逆性結合），破壞其氫鍵、疏水鍵而使MMPs不能發揮其分解明膠的作用，而只有當將膠置Triton中洗脫（是放在搖床上搖，30min/次，做2次或15min/次，4次。靜置于Trition中是不妥的。）時，由于SDS被Triton結合而去除，從而使MMPs恢復了活性。